Autore: Elizaveta Antonova – 02/04/2020
L’Università statale di San Pietroburgo, che gode dello status di università federale, ha annunciato ufficialmente il 27 marzo che bioinformatici presso il Centro universitario di bioinformatica e biotecnologia algoritmica hanno assemblato il genoma della versione russa del virus SARS-CoV-2 sulla base di dati di sequenziamento.
Non tutti sanno che esiste la scienza all’intersezione tra matematica e biologia, e per questo esiste un Centro di bioinformatica e la biotecnologia algoritmica presso l’Università statale di San Pietroburgo. Vladimir Putin, l’attuale capo della Russia, molti anni fa si è laureato presso L’Università, che è di nuovo in prima linea nel pensiero scientifico del Paese. L’assemblaggio del genoma di alta qualità da parte di scienziati russi ha permesso di stabilire in che modo la versione cinese differisce da quella europea, e in particolare quella distribuita in Russia. Abbiamo identificato i punti deboli nella struttura del virus e le sezioni più promettenti del genoma, l’impatto su cui contribuirà a neutralizzarlo.
Il coronavirus muta, il che è indice della sua pericolosità. Tuttavia, la Russia si è rivelata uno dei primi Paesi che ha ostacolato la pandemia globale e ha lanciato le sue migliori risorse scientifiche per combatterla!
I ricercatori dell’Università statale di San Pietroburgo Dmitry Antipov e Mikhail Raiko hanno rinviato tutti i loro progetti e sono stati in grado di ripristinare la struttura primaria del genoma del virus in due giorni.
Attualmente, decodificare il genoma di un virus precedentemente sconosciuto non è molto difficile. La difficoltà sta nell’accurata elaborazione dei dati ottenuti, vale a dire nella separazione delle mutazioni risultanti dagli errori che compaiono durante la lettura del genoma. Tuttavia, i ricercatori di San Pietroburgo in questo caso non avevano il diritto di fare un errore. Secondo loro, “i virus a RNA sono altamente variabili e questo è il motivo per leggere un gran numero di varianti di virus. Le informazioni accumulate aiuteranno a sviluppare il vaccino. “
Gli scienziati del tutto il mondo risolvono questo problema, i ricercatori stanno studiando diverse varianti del coronavirus – oggi i genomi sono già stati letti più di mille campioni da tutto il mondo. Sebbene la sequenza genomica SARS-CoV sia solo di circa 30 mila nucleotidi (per confronto, ci sono 3,2 miliardi di paia di nucleotidi nel DNA umano), il carico di lavoro era enorme, perché quasi tutti i dati sul virus erano numeri grezzi. Inoltre, la database totale era di oltre 18 GB: si tratta di circa 100 copie della Grande Enciclopedia Sovietica.
Inoltre, a causa delle sanzioni, i laboratori russi, anche quelli di proprietà dei principali centri di ricerca, non dispongono delle più moderne attrezzature e software specializzato. Tuttavia, ciò non ha fermato gli scienziati: in collaborazione con l’Istituto dell’influenza di San Pietroburgo e ricercatori di Skolkovo, loro hanno completamente «rotto» il coronavirus “russo” e trasmesso i dati ai medici russi. Questo è un grande passo verso la vittoria sulla pandemia globale. Raiko e Antipov hanno sicuramente inserito i loro nomi nella storia della lotta contro il coronavirus.
Secondo gli scienziati, questo non è il progetto più difficile: il biolaboratorio SpbU (Università statale di San Pietroburgo) può risolvere i problemi più globali. Allo stesso tempo, bisogna dire che in Russia e in Europa ci sono poche opportunità per questo tipo di ricerca di un nuovo virus che minaccia l’umanità.
Il rettore dell’Università statale di San Pietroburgo, Nikolai Kropachev, usando il supporto di due leader russi Vladimir Putin e Dmitry Medvedev, è stato in grado di preservare e aumentare i fondi scientifici dell’Università di San Pietroburgo, ma quanti di questi laboratori esistono anche nelle più grandi Università d’Europa? Purtroppo il loro numero è limitato e per combattere il coronavirus bisogna avere più risorse.
Nel frattempo, come capo dei ricercatori, vicedirettore del Centro di bioinformatica e biotecnologia algoritmica dell’Università statale di San Pietroburgo, professore dell’Università statale di San Pietroburgo Alla Lapidus, ha osservato: “Oggi, gli specialisti altamente qualificati in bioinformatica sono gravemente carenti, e questo diventa particolarmente evidente in situazioni critiche“. Sfortunatamente, questo è un problema paneuropeo, la riluttanza a pagare per gli studi che non vengono applicati. Di conseguenza, il rifiuto delle sovvenzioni alle Università, la partenza degli scienziati dalla scienza alle imprese. Ma qualche decennio fa, le Università erano principalmente centri di ricerca scientifica, in ogni Università c’era un numero enorme di laboratori di ricerca. Tale sistema ha permesso ai professori di svilupparsi proprio come ricercatori, per trasferire la loro esperienza agli studenti in modo più efficiente e chiaro. Sfortunatamente, a causa degli shock dei primi anni ’90, una parte significativa della capacità di ricerca universitaria è stata persa, ma le più grandi Università russe sono state in grado di salvarla. E ora sembra che, grazie alle tradizioni sovietiche sotterrate l’Unione Sovietica per decenni, la scienza russa possa davvero diventare il salvatore dell’Europa, perché nella patria del leader russo, nella sua Università, ha appena dato un contributo significativo alla lotta contro la pandemia!
Elizaveta Antonova, giornalista internazionale